文献类型：学位论文

中文题名：GSTP1和NLRP3基因多态性与COPD的关联性研究

作者：张春艳[1];

第一作者：张春艳

机构：[1]甘肃中医药大学;

第一机构：甘肃中医药大学

导师：王新华;甘肃中医药大学

授予学位：硕士

语种：中文

中文关键词：谷胱甘肽S转移酶P1;核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3;慢性阻塞性肺疾病;遗传变异;基因多态

年份：2023

摘要：目的:本研究拟通过病例对照研究,采用Taq Man-MGB探针基因分型技术对抗氧化酶GSTP1及炎性小体NLRP3进行基因遗传变异的多态性研究,探究GSTPl和NLRP3基因多态性与COPD的关联,以进一步阐明GSTP1与NLRP3不同基因型与COPD患病风险的关联,以期对COPD易感人群的早期预防和治疗提供理论依据及方案。方法:1.基因位点的筛选:通过NCBI、千人基因组计划数据库进行初筛,从GSTP1和NLRP3基因的所有位点中初步筛选出最小等位基因频率(MAF)>0.05且满足哈迪-温伯格平衡的SNP位点,再使用Haploview 4.2进行连锁不平衡分析,通过其标签功能最终选择了4个标签SNP位点进行后续实验。2.实验方法:提取纳入研究对象血液样本的DNA,所提取的DNA浓度和纯度经检测合格后将其标化至30ng/μl,后配置混合液进行加样,加入18.5μl PCR反应混合液,再依次加入l.5μl DNA模板,后进行PCR循环反应。3.统计分析方法:计量资料用均数±标准差(x±s)表示,计数资料采用百分数(%)表示。对于不同组间比较,在数据类型为计数资料和计量资料的情况下,通常采用χ检验和t检验进行分析。在研究基因多态性和COPD易感性之间的关系时,使用多因素Logistic回归模型,并计算优势比(OR)及其95%置信区间(CI),同时对年龄、性别、吸烟等影响因素进行Logistic回归分析来进行校正,并采用分层分析和交互作用分析各层各因素下基因型与COPD患病风险之间的关联,层间异致性检验采用Breslow-Day检验,显著性水平以P<0.05为判断标准,认为差异具有统计学意义,统计软件使用SPSS 25.0。结果:1.研究对象的一般特征共有312例符合标准的COPD患者被纳入COPD组,314人作为对照组。COPD组和对照组的年龄、性别、BMI、吸烟分布均存在显著差异(P<0.05),但是两组的婚姻状况、饮酒、既往史分布均无显著差异(P>0.05)。2.GSTP1基因多态性与COPD患病风险的关联分析rs4147581C>G的三种基因型CC、CG、GG在病例组和对照组之间的分布具有显著性差异(P<0.05)。Logistic结果显示,rs4147581C>G的遗传变异在加性模型、显性模型中与COPD患病风险之间的关联存在统计学意义(P<0.05)。rs1695A>G的三种基因型AA、AG、GG在病例组和对照组之间的分布差异在统计意义上不显著(P>0.05)。但在校正性别、年龄、BMI、吸烟后,分析结果显示rs1695A>G的遗传变异在显性模型中与COPD患病风险之间的关联存在统计学意义(P<0.05)。3.NLRP3基因多态性与COPD患病风险的关联分析rs3806265T>C的三种基因型TT、TC、CC在病例组和对照组之间的分布具有显著性差异(P<0.05)。Logistic结果显示,rs3806265T>C的遗传变异在显性模型中与COPD患病风险之间的关联存在统计学意义(P<0.05)。rs10754558G>C的三种基因型GG、GC、CC在病例组和对照组之间的分布差异在统计意义上不显著(P>0.05)。校正性别、年龄、BMI、吸烟等因素后,分析结果显示rs10754558G>C的遗传变异在三种模型中与COPD患病风险之间的关联均不存在统计学差异(P>0.05)。4.SNPs与COPD患病风险的分层分析和交互作用分析分层分析结果显示,rs4147581 C>G在显性模型下以CC作为参照,根据年龄、性别、吸烟分层时层间不具有同质性(P<0.05),但根据BMI、婚姻状况、饮酒情况、既往疾病史分层时层间具有同质性(P>0.05)。相乘交互作用分析结果表明,婚姻状况、BMI、既往疾病史、吸烟和饮酒与rs4147581C>G的GG/GC基因型不存在相乘交互作用(P>0.05),但年龄、性别与rs4147581C>G的GG/GC基因型存在相乘交互作用(P<0.05)。rs1695A>G在显性模型下以AA作为参照,根据年龄、既往疾病史分层,层间不具有同质性(P<0.05),但根据性别、BMI、婚姻状况、饮酒情况、吸烟分层,层间具有同质性(P>0.05)。相乘交互作用分析结果表明,年龄、性别、婚姻状况、BMI、吸烟和饮酒与rs1695A>G的GG/AG基因型不存在相乘交互作用(P>0.05),但既往疾病史与rs1695A>G的GG/AG基因型存在相乘交互作用(P<0.05)。rs3806265T>C在显性模型下以TC/CC作为参照,根据年龄、性别、BMI、饮酒情况、既往疾病史分层时层间具有同质性(P>0.05),但根据吸烟、婚姻状况分层时层间不具有同质性(P<0.05)。相乘交互作用分析结果表明,年龄、性别、婚姻状况、BMI、既往疾病史与rs4147581C>G不存在相乘交互作用(P>0.05),但吸烟、饮酒与rs4147581C>G存在相乘交互作用(P<0.05)。结论:1.GSTP1基因多态性与COPD的患病风险存在相关性,rs4147581C>G的遗传变异与COPD患病风险存在关联,携带等位基因G者慢性阻塞性肺疾病患病风险更高。rs1695A>G的遗传变异与COPD患病风险无关。2.NLRP3基因多态性与COPD的患病风险存在相关性,rs3806265 T>C的遗传变异与COPD患病风险存在关联,携带等位基因T者慢性阻塞性肺疾病患病风险更高。rs10754558G>C的遗传变异与COPD患病风险无关。3.rs4147581C>G的遗传变异对于COPD患病风险的影响与性别、年龄存在相乘交互作用,rs3806265 T>C的遗传变异对于COPD患病风险的影响与吸烟、饮酒存在相乘交互作用。